1、主要是保護和利用天敵，也可利用對人畜無害而僅對鼠類有致命危險的微生物病原體。應加保護的鼠類天敵在哺乳類中有黃鼬(黃鼠狼)、艾虎(艾鼬)、香鼬(香鼠)、狐貍、兔猻、猞猁、野貍和家貓等，鳥類中有長耳鸮、短耳鸮、縱紋腹小鸮等貓頭鷹類，爬行類動物中主要是各種蛇類等。為此需注意保護天敵。
2、用毒。主要是使有毒物質進入害鼠體內，破壞鼠體的正常生理機制而使其中毒死亡。效果快、使用簡便、廣泛用于大面積滅鼠時能暫時降低鼠的密度和把危害控制在最小程度。
3、利用器械滅鼠。多用于倉庫、畜舍、野外動物調查等方面，常用的器械有鼠鋏、鼠籠、繩套、壓板、水淹、刺殺等。電流擊鼠效果較慢，常用作輔助工具。