水質檢測指標包括色度、渾濁度、臭和味、肉眼可見度、余氯等。飲用水主要考慮對人體健康的影響，其水質標準除有物理指標、化學指標外，還有微生物指標。對工業用水則考慮是否影響產品質量或易于損害容器及管道。
各地區應對地下水水質進行定期檢測。檢驗方法，按國家標準GB5750《生活飲用水標準檢驗方法》執行。各地地下水監測部門，應在不同質量類別的地下水域設立監測點進行水質監測，監測頻率不得少于每年二次（豐、枯水期）。
監測項目為：pH、氨氮、硝酸鹽、亞硝酸鹽、揮發性酚類、砷、汞、鉻（六價）、總硬度、鉛、氟、鎘、鐵、錳、溶解性總固體、高錳酸鹽指數、硫酸鹽、氯化物、大腸菌群，以及反映本地區主要水質問題的其它項目。